基因数据分析软件迁移-rMATS-4.1.0

前提条件，推荐安装gcc5.4.0环境，必须R语言环境

安装依赖

yum install -y python-devel gsl-devel blas blas-devel lapack lapack-devel git

pip install -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple cython --trusted-host pypi.tuna.tsinghua.edu.cn

pip install -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple numpy --trusted-host pypi.tuna.tsinghua.edu.cn

下载软件包

Wget https://github.com/Xinglab/rmats-turbo/releases/download/v4.1.0/rmats_turbo_v4_1_0.tar.gz

解压软件包

tar -xf rmats_turbo_v4_1_0.tar.g

修改rmats-turbo-4.1.0/rMATS_C/Makefile如下：

执行编译安装

./build_rmats

基因测序

版权声明：本文内容由网络用户投稿，版权归原作者所有，本站不拥有其著作权，亦不承担相应法律责任。如果您发现本站中有涉嫌抄袭或描述失实的内容，请联系我们jiasou666@gmail.com 处理，核实后本网站将在24小时内删除侵权内容。