基因数据分析软件迁移-scvelo

安装依赖

yum install hdf5 hdf5-devel blosc blosc-devel -y

pip install cython -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple

安装lzo2,下载源码到本地目录

wget https://github.com/damageboy/lzo2/archive/refs/heads/master.zip

解压软件包

unzip master.zip

进入解压目录

cd lzo2-master

执行编译安装

./configure --enable-shared=yes && make -j 16 && make install

安装scvelo

pip install scvelo -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple

备注：

此报错表示hdf5依赖未安装

此报错表示需要安装numpy和pyparsing，并且需要安装对应版本

基因测序

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