基因数据分析软件迁移-GATK

安装依赖

yum install -y git-lfs

下载源码包

git clone https://github.com/broadinstitute/gatk.git

执行编译构建

./gradlew bundle

编译成功标识

安装，将以上结果拷贝到需要安装的主机，解压目录

unzip gatk-4.2.2.0-22-gf3df0b3-SNAPSHOT.zip

修改目录名称

mv gatk-4.2.2.0-22-gf3df0b3-SNAPSHOT gatk-4.2.20-22

设置环境变量

基因测序

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