基因数据分析软件迁移-FACETS

下载软件包到本地

wget https://github.com/mskcc/facets/archive/refs/tags/v0.6.2.tar.gz -o facets-0.6.2.tar.gz

安装软件包：(linux 命令行执行)

R CMD INSTALL facets-0.6.2.tar.gz

依赖于pctGCdata，下载软件包

wget https://github.com/veseshan/pctGCdata/archive/refs/tags/v0.3.0.tar.gz -o pctGCdata-0.3.0.tar.gz

安装pctGCdata

R CMD INSTALL pctGCdata-0.3.0.tar.gz

再次执行步骤2，安装facets

验证

library(“facets”)

基因测序

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