鲲鹏服务器上源码部署基因测序软件kentUtils

kentUtils是与UCSC基因组浏览器结合使用的一系列生物信息学实用程序。

1       安装准备

华为云购买一台鲲鹏服务器

本文以云服务器KC1实例搭建，云服务器配置如表1-1所示。

表1-1 云服务器配置

项目

说明

规格

kc1.large.2 | 2vCPUs | 4GB

磁盘

系统盘：高IO（40GB）

表1-2 CentOS操作系统要求

项目

说明

-

CentOS

7.6

在公共镜像中已提供。

Kernel

4.14.0-115

在公共镜像中已提供。

2       配置编译环境

安装依赖。

yum install zlib-devel openssl-devel libpng-devel mysql-devel -y

3       获取源码

cd /usr/local/src wget https://github.com/ENCODE-DCC/kentUtils/archive/v302.1.0.tar.gz -O kentUtils-302.1.0.tar.gz

4       编译和安装

tar -zxvf kentUtils-302.1.0.tar.gz cd kentUtils-302.1.0 make -j4

5       运行和验证

查看工具集

cd /usr/local/src/kentUtils-302.1.0/bin ls

鲲鹏 基因测序

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