鲲鹏云服务器安装miranda

miRanda是一种用于寻找microRNA基因组靶标的算法。该算法已用C语言编写，可以作为GPL下的开源方法使用。

开发语言：C/C++

云服务器要求

本文以云服务器KC1实例测试，云服务器配置如表 云服务器配置所示。

项目

说明

规格

kc1.large.2 | 4vCPUs | 8GB

磁盘

系统盘：高IO（40GB）

操作系统要求

操作系统要求如表 操作系统要求所示。

项目

说明

-

CentOS

7.6

在公共镜像中已提供。

Kernel

4.14.0-115

在公共镜像中已提供。

安装相关依赖。

yum install -y wget

获取“miRanda-3.3a”源码包。

cd /usr/local/src

wget http://cbio.mskcc.org/microrna_data/miRanda-aug2010.tar.gz

解压并进入源码包。

tar -zxvf miRanda-aug2010.tar.gz

cd miRanda-3.3a

生成Makefile文件。

./configure --prefix=/usr/local/miRanda --host=arm-linux --build=arm-linux

编译安装miRanda。

make -j4 && make install

查看miRanda版本信息。

/usr/local/miRanda/bin/miranda --version

回显类似如下信息代表miRanda安装成功。

=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=miranda v3.3a     microRNA Target Scanning Algorithm=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-==-=-=-=-=-=-=

鲲鹏

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