GaussDB(DWS)基本IO框架

网友投稿 861 2022-05-28

概述

数据库的IO结构一直是影响性能的关键部分,数据库的操作最终还是要体现在最后的物理文件上。我们平常总是听到各种缓存,这都是为了减小IO开销而设计的。

对于数据库来说,因为要保证一致性的问题,那么IO模型的设计就更为复杂,既要保证减少IO的读写,又要保证突然断电时,已提交事务的内容不能丢失等意外情况。此外,采用不同的索引结构设计的IO开销也不一样,理解IO模型对数据库的调优也有一定的指导作用。

本篇博文分别从读取和写入两个方面讲解了GaussDB(DWS)中的行存,列存基本IO模型。

行存IO基本框架

存储结构

在了解行存的整个IO框架之前,首先需要对行存的文件结构有一定的了解。那么我们平常操作的表都是怎么样存储在我们的文件系统中呢?

就跟我们平常用的身份证号一样,在GaussDB(DWS)中,也有对应的ID号来标识各个对象:

OID(Object identifiers):对象的唯一标识。

每个表存在对应数据库的文件夹中,用relfilenode标识。

通过各种ID,我们就可以查看每个表对应的文件了。

例如表row1,可以直接查询对应的文件:

test=# select pg_relation_filepath('row1'); pg_relation_filepath ---------------------- base/16385/55984 (1 row)

对于行存来说,我们常有的印象是以行为单位进行读取和写入的,但是这个对于IO开销就过于严重了,因此GaussDB(DWS)采用和操作系统的思路,以页为基本单位进行读取和写入。

每个表的读取写入以页(文件块)为基本单位,页的大小是一个BLCKSZ,默认8KB,其结构如下:

Tuple保存了当前一行的数据,分为Header和Data两块,头部保存元组的相关信息(列数,事务信息,是否有Toast表等)。

每个Tuple最大为2kb,若Data过大无法压缩至2KB,则采用额外的Toast表存储,此时Tuple内的Data保存Toast表的相关信息。

GaussDB 行存框架:

行存无论在读取还是写入上,都采用了大量的缓存用来减少IO开销。

在外存方面,针对数据库的特点,也单独设计了外存管理器。整个框架如下:

这里面涉及到几个比较大的内核机制:

本地缓存:

这里面的本地缓存介绍了三个比较常用的缓存结构,这里直接引用了官方的英文解释。

temp_buffers: Sets the maximum number of temporary buffers used by each database session. These are session-local buffers used only for access to temporary tables.

work_mem: Specifies the amount of memory to be used by internal sort operations and hash tables before writing to temporary disk files.

maintenance_work_mem: Specifies the maximum amount of memory to be used by maintenance operations, such as VACUUM, CREATE INDEX, and ALTER TABLE ADD FOREIGN KEY.

共享内存:可由整个Gaussdb共享

包括shared_buffer和wal_buffer, 分别用来存放Page和Clog,Wal Segment。

WalWriter,BgWriter:

主要是将共享内存的内容落盘,WalWriter一般是在事务提交时就需要落盘,但是有时候可以放弃一定的事务一致性原则,从而让WalWriter异步落盘加快速度。BgWriter负责将shared_buffer中的内容落盘。

外存管理:

负责上层与外存之间的文件交互。

IO管理框架:读取

读取的过程相对简单,就是从物理文件先装到shared_buffer中,然后从shared_buffers返回相关的结果。

shared_buffers中就是以Page为单位进行存储的,因为每个Page的大小是固定的,所以shared_buffers能存放的page个数也就是确定的。这里面就需要考虑一个问题,因为这个资源是共享的,如果一个线程读取了大量的文件,这样势必会使得其他线程的缓存命中率下降。

GaussDB在这里引入了Ringbuffer的机制,可以限制一个线程所使用的shared_buffers的大小,从而解决掉这个问题。

IO管理框架:写入

写入操作是增加的新的元组,Update操作相当于先Delete, Insert。

INSERT

增加一个新的元组和对应的line pointer的标记。

UPDATE

删除旧的元组,可以看见Tuple1的HEAD标记了Delete, Data在图中标记为了Delete只是为了说明这个Tuple被删除了。然后增加新的元组

将旧元组标记为Dead,然后插入新的元组,由Vacuum负责清理。当然,这里面Data变为DELETE只是用来描述删除的是此Tuple,实际上Data当中的值是不变的。

写入的整体逻辑:

GaussDB行存在写入时,将元组信息先写入到shared_buffers,然后用bgwriter刷入磁盘,这样在事务提交时就可以避免磁盘的IO开销,提升性能,为了保证一致性和恢复,使用wal日志和checkpoints可以实现日志先落盘(也可以异步)和redo等操作。

列存的IO管理框架

列存的存储单元

列存的存储结构并没有像orc或parquet的结构方式,采用了一种真正的以列存储的结构方式。主要的特性如下:

列存的存储单元为CU(CStore Unit)

CU的大小为8k对齐

适合大批量导入的场景

同一列的CU存在一个新文件中,大于1GB时,切换到新文件中。

列存用一个CUDesc的行存表描述CU的相关信息,可以理解成为一个Toast表。

CUDesc:行存表,记录CU的相关信息, 主要属性如下:

col_id,cu_id: 第col_id列,第cu_id个CU

min, max, row_count, size

cu_mode: information mask(RLE,LZ4,Delta表等)

cu_pointer:指向每一个CU,记录delete bitmap

magic:和CU头部的magic相同,校验使用

CU结构

和传统的文件结构类似,也是以头和压缩后的数据为主要结构。

列存索引

这里介绍两个索引,C-Btree和Psort索引。这也是各大数据库常用的两个索引,主要涉及的是IO相关的内容。

C-Btree

GaussDB(DWS)基本IO框架

列存的Btree原理上并不是基于普通的Btree,而更像是一种B+树。

索引结构和行存无差别,同样以行存形式存储

C-Btree可以提升点查效率

存储key->ctid(cu_id, offset)

过程:

根据B-tree索引找到ctid集合

对集合进行批量排序(减少IO开销)

在CUDesc找到对应的cu_id,根据offset找到数据

举例,等值查询 n=49, 范围查询 23

PSort

PSort是一个聚簇索引,对索引进行排序,然后将排序后的索引和行号存入一个新的表,用单独的列存表存储。

简单示意如下,图片来源:https://www.modb.pro/db/108155

IO管理框架:读取

列存的读取和行存一样,也是设计了缓存,这样在重复查询的时候可以显著减少IO开销,提高性能。

读取过程:

根据where条件,做MIN/MAX过滤的谓词条件

加载CUDesc

MIN/MAX过滤

读取CU到CU Cache中

解析并填充

CacheMgr: 用来缓存CU到内存中,可以提高重复查询的性能。

CU的物理文件:

1. CStore_1.0: 当前基本不怎么实用

2. CStore_2.0: 重整了CU的文件结构,避免列数过多导致文件结构复杂。

IO管理框架:写入

列存的插入要分两种情况,少量的插入和大量的插入,列存主要是对大批量数据设计的,因此为了弥补小量插入的打包CU性能开销,设计了一个delta行存表,用来记录插入结果,可以减少膨胀和提升性能,最后定期的整理。

写入框架如下

列存的删除比较简单,如果是delta表,先从delta表中删除满足谓词条件的记录,然后在CUDesc表中更新待删除CU的delete_bitmap。

总结

以上的相关内容只是整个IO框架的大体描述。可以看出因为涉及的场景不同,列存和行存的模型还是有区别的。尤其是列存的写入不通过缓存,直接进入磁盘,这点与行存有着很大的区别,行存因为首先写入shared_buffers,就需要很多额外的机制来保证一致性问题。而列存则相对简单,谁好谁好都不是绝对的,这与使用场景有很深的关系。

这其中还有很多细小的点可以仔细分析,以后的博客也会针对其中某些内容深入讲解,比如说,OS缓存和GaussDB(DWS)之间的缓存交互,以及OS缓存和磁盘之间的交互逻辑,这对于一致性的实现是很重要的。

希望本篇博客能够帮助到各位读者!

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