函数evaluate不识别公式中的中括号怎么办(没有evaluate函数)
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2022-05-29
研究大分子的HELM表示。HELM具有分层结构,并结合了单体来代表聚合物(例如肽)。
HELM的特征是其表达的可扩展性,还可以通过将原始单体添加到单体库中来表达不自然的结构。
另一方面,由于HELM表达式使用缩写(ID),所以如果不共享单体库,则存在指定具有相同ID的不同单体的风险,因此了解单体库很重要。
找出什么样的单体信息存储在ChEMBL中,这是HELM也处理的熟悉的数据库。
具体旨在读取XML文件中提供的单体库,并将其转换为Pandas DataFrame。
导入库
import xml.etree.ElementTree as ET
tree = ET.parse('chembl_27_monomer_library.xml')
root = tree.getroo
XML 数据库
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