RDKit | 基于R基团分解(R-group decomposition)高亮分子

一组共享一个共同骨架的分子上做R基分解（RGD，R-group decomposition），为那些对准骨架的分子生成坐标，并生成分子图像，其中的R基团被涂上了颜色，使它们容易被挑选出来。

注：RDKit版本≥2020.09.1

导入库

import rdkit

from rdkit import Chem

from rdkit.Chem import Draw

from rdkit.Chem.Draw import IPythonConsole

IPythonConsole.molSize=(450,350)

from rdkit.Chem import rdRGroupDecomposition

from rdkit.Chem import rdqueries

from rdkit.Chem import rdDepictor

from rdkit.Chem.Draw import rdMolDraw2D

from rdkit import Geometry

rdDepictor.SetPreferCoordGen(True)

import pandas as pd

from IPython.display import SVG,Image

from ipywidgets import interact

print(rdkit.__version__)

2020.09.1

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