鲲鹏云服务器源码安装randfold

randfold是一个独立的基因测序相关软件，它从原始序列开始随机显示其核苷酸顺序。它根据改组后的序列计算推断结构的最小自由能（MFE），并多次重复计算以建立最小自由能（MFE）值的分布。

云服务器要求

本文以云服务器KC1实例测试，云服务器配置如表 云服务器配置所示。

项目

说明

规格

kc1.large.2 | 4vCPUs | 8GB

磁盘

系统盘：高IO（40GB）

操作系统要求

操作系统要求如表 操作系统要求所示。

项目

说明

下载地址

CentOS

7.6

在公共镜像中已提供。

Kernel

4.14.0-115

在公共镜像中已提供。

安装相关依赖。

yum install -y git

获取“randfold”源码包。

cd /usr/local/

git clone https://github.com/eb00/randfold.git

编译randfold

cd randfold/src/squid-1.9g

./configure && make

编译randfold。

cd ../

make

编译完成后会生成可执行文件“randfold”。

设置软连接。

ln -s /usr/local/randfold/src/randfold /usr/bin/randfold

执行如下测试命令。

randfold -d let7.tfa 999

当系统回显类似如下信息是，表示randfold执行成功。

cel-let-7       -42.90  0.001000

鲲鹏

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